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É só um CSS simples usando media queries para exibir dois links diferentes: um que abre o WhatsApp web, em telas maiores, e um que usa a API do WhatsApp, para celulares.
Eu vou fazer um plugin para colocar automaticamente muito em breve (creio que em uma ou duas semanas.)
Por agora, você pode colar o código no rodapé do seu site:
Aparência > Editor
Ir até o arquivo footer.php e colar no começo do arquivo.
Não altere nada além disso no arquivo. Não delete nem substitua nada se você não souber o que está fazendo.
Não se esqueça de atualizar o arquivo.